تقوم معدات تنظيف الحبوب بفصل الحبوب والشوائب بناءً على الاختلافات في الخصائص الفيزيائية مثل حجم الجسيمات والجاذبية النوعية والشكل وخصائص تدفق الهواء ومقاومة الاحتكاك والتأثير. تشمل الأنواع الرئيسية المعدات التي يتم فصلها حسب حجم الجسيمات، والجاذبية النوعية، والشكل، وخصائص تدفق الهواء، ومقاومة الاحتكاك والتأثير، بالإضافة إلى المعدات المدمجة التي تدمج وظائف الفحص المتعددة.
تستخدم المعدات التي تفصل حسب حجم الجسيمات شبكة سلكية منسوجة أو ألواح معدنية مثقبة كسطح للشاشة، مع الاستفادة من حجم فتحات الشاشة للغربلة. المعدات ذات فتحات الغربلة الأكبر قليلاً من الحد الأقصى لقطر جزيئات الحبوب تسمح للحبوب والشوائب الأصغر بالمرور عبر فتحات الغربلة، بينما يتم تفريغ الشوائب الأكبر حجمًا. تشمل الأمثلة شبكات الشوائب الكبيرة والشبكات الأسطوانية، والتي تستخدم عادة للتنظيف الأولي عندما تدخل الحبوب إلى المستودع. تسمح المعدات ذات فتحات الغربلة الأصغر من الحد الأدنى لقطر جزيئات الحبوب للشوائب الصغيرة بالمرور وإزالتها، بينما يتم تفريغ الحبوب بحجم كبير. يتضمن ذلك الغرابيل الاهتزازية الترددية، والغرابيل الدوارة المسطحة، والغرابيل الاهتزازية عالية السرعة-، المستخدمة للتنظيف بعد مغادرة الحبوب للمستودع وقبل معالجتها. تحتوي الغرابيل الاهتزازية الترددية عادةً على ثلاث طبقات من أسطح الغربال لتفريغ الشوائب الكبيرة وأنواع مختلفة من الحبوب والشوائب الصغيرة بشكل منفصل. تحتوي الشاشة الدوارة المستوية على جسم شاشة معلق بواسطة ذراع يدور بحركة مستوية، ولها سطحان للشاشة. تحتوي الشاشة الاهتزازية- ذات السرعة العالية على جسم شاشة يتحرك بحركة دائرية ذات سعة صغيرة- في مستوى عمودي، ولها سطحان إلى أربعة أسطح شاشة. إنه فعال لفصل عشب الفناء عن الأرز.
يستخدم الفصل بالجاذبية لفصل الشوائب المشابهة في الحجم والشكل لجزيئات الحبوب ولكنها مختلفة في الوزن، مثل الحجارة والطين. وتشمل الطرق العمليات الرطبة والجافة. المعدات النموذجية للفصل الرطب هي آلة غسل وتجفيف القمح، بينما تشتمل معدات الفصل الجاف على جهاز إزالة الحجارة بالجاذبية وجدول تصنيف الجاذبية. يستخدم جهاز إزالة الحجارة بالجاذبية لوحة مثقوبة مائلة ومهتزة وتدفق هواء يتم التحكم فيه لجعل الحبوب تتدفق في حالة شبه معلقة إلى الأسفل ويتم تفريغها. تلتصق الشوائب الثقيلة بسطح اللوحة، وترتفع، ويتم تفريغها عبر منطقة تجميع الحجر-. يعمل جدول التصنيف بالجاذبية بشكل مشابه لأداة إزالة الحجارة بالجاذبية، حيث يقوم أولاً بفصل الحبوب إلى قسمين وفقًا لوزنها ومن ثم تنظيفها بشكل منفصل. معدات الفصل الجاف توفر المياه وتتجنب تلوث مياه الصرف الصحي.